Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms