Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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