Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COL6A2P12110 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL6A2P12110 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COL6A2P12110 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COL6A2P12110 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL6A2P12110 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COL6A2P12110 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL6A2P12110 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL6A2P12110 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL6A2P12110 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL6A2P12110 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL6A2P12110 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms