Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms