Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TOP2AP11388 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms