Protein–RNA interactions for Protein: P08670

VIM, Vimentin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIMP08670 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VIMP08670 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VIMP08670 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VIMP08670 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VIMP08670 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VIMP08670 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VIMP08670 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VIMP08670 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VIMP08670 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VIMP08670 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VIMP08670 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIMP08670 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIMP08670 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms