Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 TAS2R1-201ENST00000382492 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCNP04198 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 SNCA-202ENST00000345009 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 LINC01259-201ENST00000507056 757 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC103982.1-201ENST00000561358 571 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AL139317.4-201ENST00000605879 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYCNP04198 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC019294.1-201ENST00000395215 1184 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYCNP04198 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms