Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SIX3O95343 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX3O95343 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX3O95343 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX3O95343 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX3O95343 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX3O95343 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX3O95343 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX3O95343 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX3O95343 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX3O95343 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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