Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CCNDBP1O95273 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CCNDBP1O95273 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CCNDBP1O95273 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1O95273 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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