Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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KDM4BO94953 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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KDM4BO94953 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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KDM4BO94953 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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KDM4BO94953 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KDM4BO94953 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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KDM4BO94953 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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KDM4BO94953 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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KDM4BO94953 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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KDM4BO94953 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KDM4BO94953 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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