Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PDE6DO43924 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PDE6DO43924 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PDE6DO43924 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PDE6DO43924 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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