Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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