Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLGNO14967 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms