Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms