Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTLL13PA6NNM8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTLL13PA6NNM8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms