Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms