Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms