Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms