Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms