Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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