Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SNX6Q9UNH7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SNX6Q9UNH7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SNX6Q9UNH7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SNX6Q9UNH7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SNX6Q9UNH7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SNX6Q9UNH7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SNX6Q9UNH7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SNX6Q9UNH7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNX6Q9UNH7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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