Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX3Q9UBR4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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