Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms