Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms