Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms