Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms