Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD9AQ99638 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms