Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms