Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FGD4Q96M96 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.2 ms