Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms