Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 355.5 ms