Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms