Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms