Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC33Q8N5R6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms