Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms