Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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LRRC38Q5VT99 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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LRRC38Q5VT99 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC38Q5VT99 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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