Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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PRAMEF20Q5VT98 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRAMEF20Q5VT98 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRAMEF20Q5VT98 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRAMEF20Q5VT98 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PRAMEF20Q5VT98 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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PRAMEF20Q5VT98 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PRAMEF20Q5VT98 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRAMEF20Q5VT98 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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