Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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