Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC092335.1-201ENST00000509037 2066 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC133065.6-201ENST00000625054 2378 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDE9A-210ENST00000398229 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA14-202ENST00000437161 1689 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms