Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms