Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms