Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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RRN3P1Q2M238 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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RRN3P1Q2M238 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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RRN3P1Q2M238 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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