Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms