Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms