Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
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EEA1Q15075 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
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EEA1Q15075 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
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