Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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