Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CBFBQ13951 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CBFBQ13951 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CBFBQ13951 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CBFBQ13951 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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