Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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