Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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PTCH1Q13635 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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