Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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